Os dipeptídeos pseudo-prolina contêm oxazóis formados a partir de serina ou treonina. Quando tratados com ácido trifluoroacético (TFA), os oxazóis são convertidos em serina ou treonina. Os oxazóis têm similaridade estrutural com a prolina e, portanto, são denominados pseudo-prolina. Como a prolina, a pseudo-prolina forma uma "torção" na espinha dorsal da poliamida do peptídeo. Essa torção interrompe as ligações de hidrogênio do intercâmbio responsáveis pela agregação. A incorporação de pseudo-prolina na sequência peptídica melhora a eficiência do acoplamento, aumentando assim a pureza e o rendimento do peptídeo. O acoplamento à pseudo-prolina é difícil e o rendimento de acoplamento é geralmente baixo. Portanto, a pseudo-prolina é usada como um dipeptídeo de pseudo-prolina pré-formado na síntese de peptídeos.
A pseudoprolina é estável sob condições fracamente ácidas. Os peptídeos contendo pseudoprolina podem ser preparados em resina 2-clorotrityl ou resina sieber e clivados na presença de pseudoprolina.
Comparados com os peptídeos padrão correspondentes, os peptídeos contendo pseudo-prolina têm melhor solubilidade. Isso facilita a pseudo-prolina mais fácil de purificar e usar em reações de condensação de fragmentos. Além disso, os peptídeos com pseudo-prolina no terminal C podem ser acoplados sem racemização do resíduo C-terminal.
O nó causado por pseudo-prolina em peptídeos lineares ajuda a formar peptídeos cíclicos. Foi relatado que a adição de pseudo-prolina pode aumentar o rendimento de peptídeos cíclicos e acelerar a reação de ciclização.
A pseudo-prolina interrompe as ligações de hidrogênio no esqueleto peptídico.
A pseudo-prolina interrompe as ligações de hidrogênio entre as cadeias peptídicas.
A pseudo-prolina bloqueia a formação de subprodutos de asparagina e aqueles produzidos pela formação de asparagina. É usado na semi-síntese da subunidade R2 da Escherichia coli ribonucleotídeo redutase. Este método também foi aplicado recentemente à síntese do domínio glicopeptídico da eritropoietina.
Diretrizes para o uso do dipeptídeo de pseudoprolina
Se possível, insira uma pseudo-prolina antes da região hidrofóbica.
Deve haver pelo menos dois aminoácidos entre os resíduos de pseudo-prolina ou entre pseudo-prolina e prolina.
O espaçamento ideal é de 5 a 6 aminoácidos entre pseudo-prolinas ou entre uma pseudo-prolina e uma prolina.
Horário de postagem: 2025-08-13