Os peptídeos que penetram nas células são pequenos peptídeos que podem penetrar facilmente na membrana celular. Essa classe de moléculas, especialmente os CPPs com funções de segmentação, é promissora para a administração eficiente de medicamentos nas células -alvo.
Portanto, a pesquisa sobre ela tem certa significado biomédico. Neste estudo, as CPPs com diferentes atividades transmembranares foram estudadas no nível da sequência, tentando descobrir os fatores que afetam a atividade transmembranar dos CPPs, as diferenças de sequência entre CPPs com diferentes atividades e não -CPPs e introduzir um método para analisar sequências biológicas.
CPPs and NonCPPs sequences were obtained from the CPPsite database and different literatures, and transmembrane peptides (HCPPs, MCPPs, LCPPs) with high, medium, and low transmembrane activity were extracted from the CPPs sequences to construct data sets. Com base nesses conjuntos de dados, foram realizados os seguintes estudos:
1, o aminoácido e a composição da estrutura secundária de diferentes CPPs e não -CPPs ativos foram analisados pela ANOVA. Verificou -se que as interações eletrostáticas e hidrofóbicas dos aminoácidos desempenharam um papel importante na atividade transmembranar dos CPPs, e a estrutura helicoidal e o enrolamento aleatório também afetaram a atividade transmembranar dos CPPs.
2. As propriedades físicas e químicas e os comprimentos dos CPPs com diferentes atividades foram exibidos no plano bidimensional. Verificou -se que CPPs e não -CPPs com diferentes atividades poderiam ser agrupados sob algumas propriedades especiais e HCPPs, MCPPs, LCPPs e não -CPPs foram divididos em três grupos, mostrando suas diferenças;
3. Neste artigo, é introduzido o conceito de centróide físico e químico da sequência biológica e os resíduos que compõem a sequência são considerados pontos de partícula, e a sequência é abstraída como um sistema de partículas para a pesquisa. Esse método foi aplicado à análise de CPPs projetando CPPs com diferentes atividades no método 3D pelo método PCA, e verificou -se que a maioria dos CPPs se agrupava e alguns LCPPs agrupados junto com não -CPPs.
Este estudo tem implicações para o design de CPPs e entender as diferenças nas seqüências de CPPs com diferentes atividades. Além disso, o método de análise de centróide físico e químico de sequências biológicas introduzidas neste artigo também pode ser usado para a análise de outros problemas biológicos. Ao mesmo tempo, eles podem ser usados como parâmetros de entrada para alguns problemas de classificação biológica e desempenham um papel no reconhecimento de padrões.
Horário de postagem: 2025-07-02