Na superfície, a formação de ligações peptídicas, produzindo dipeptídeos, é um processo químico simples.Isto significa que os dois componentes de aminoácidos estão ligados por uma ligação peptídica, uma ligação amida, enquanto são desidratados.
A formação da ligação peptídica é a ativação de um aminoácido sob condições de reação moderadas.(A) porção carboxila, segundo aminoácido (B) A porção carboxila ativada nucleofílica forma então o dipeptídeo (AB).“Se o componente carboxila (A) não estiver protegido, a formação da ligação peptídica não pode ser controlada.”Subprodutos tais como peptídeos lineares e cíclicos podem ser misturados com compostos alvo AB.Portanto, todos os grupos funcionais não envolvidos na formação da ligação peptídica devem ser protegidos de forma temporariamente reversível durante a síntese peptídica.
Assim, a síntese peptídica – a formação de cada ligação peptídica – envolve três etapas de agregação.
O primeiro passo é preparar alguns aminoácidos que precisam de proteção, e a estrutura zwitteriônica dos aminoácidos não existe mais.
A segunda etapa é uma reação de duas etapas para formar ligações peptídicas, nas quais o grupo carboxila do aminoácido N-protegido é primeiro ativado no intermediário ativo e então a ligação peptídica é formada.Esta reação acoplada pode ocorrer como uma reação de uma etapa ou como duas reações sequenciais.
A terceira etapa é a remoção seletiva ou remoção completa da base protetora.Embora toda a remoção só possa ocorrer após todas as cadeias peptídicas terem sido montadas, a remoção seletiva de grupos protetores também é necessária para continuar a síntese peptídica.
Porque 10 aminoácidos (Ser, Thr, Tyr, Asp, Glu, Lys, Arg, His, Sec e Cys) contêm grupos funcionais de cadeia lateral, que requerem proteção seletiva, tornando a síntese de peptídeos mais complicada.As bases de proteção temporária e semipermanente devem ser diferenciadas devido aos diferentes requisitos de seletividade.Grupos de proteção temporária são usados na próxima etapa para refletir a proteção temporária de grupos funcionais de aminoácidos ou carboxila.Grupos protetores semipermanentes são removidos sem interferir nas ligações peptídicas já formadas ou nas cadeias laterais de aminoácidos, às vezes durante a síntese.
“Idealmente, a ativação do componente carboxila e a subsequente formação de ligações peptídicas (reações de acoplamento) devem ser rápidas, sem formação racêmica ou de subprodutos, e reagentes molares devem ser aplicados para obter altos rendimentos.”Infelizmente, nenhum dos métodos de acoplamento químico satisfaz estes requisitos e poucos são adequados para síntese prática.
Durante a síntese de peptídeos, os grupos funcionais envolvidos em diversas reações geralmente estão ligados ao centro manual, sendo a glicina a única exceção, e existe um risco potencial de rotação.
A etapa final no ciclo de síntese peptídica é a remoção de todos os grupos protetores.A remoção seletiva de grupos protetores é importante para a extensão da cadeia peptídica, além da necessidade de remoção completa da proteção na síntese de dipeptídeos.As estratégias sintéticas devem ser cuidadosamente planeadas.Dependendo da escolha estratégica, o N pode remover seletivamente os grupos protetores α-amino ou carboxila.O termo “estratégia” refere-se à sequência de reações de condensação de aminoácidos individuais.Em geral, há uma diferença entre a síntese gradual e a condensação de fragmentos.A síntese de peptídeos (também conhecida como “síntese convencional”) ocorre em solução.Na maioria dos casos, o alongamento gradual da cadeia peptídica só pode ser sintetizado usando a cadeia peptídica para sintetizar fragmentos mais curtos.Para sintetizar péptidos mais longos, as moléculas alvo devem ser segmentadas em fragmentos apropriados e determinado que podem minimizar o grau de diferenciação no terminal C.Depois que os fragmentos individuais forem gradualmente montados, o composto alvo será unido.A estratégia de síntese peptídica inclui a seleção do melhor e mais apropriado fragmento protetor, e a estratégia de síntese peptídica inclui a seleção da combinação mais apropriada de bases protetoras e do melhor método de conjugação do fragmento.
Horário da postagem: 19 de julho de 2023