Esquema de projeto e solução da cadeia peptídica polipeptídica

I. Resumo
Os peptídeos são macromoléculas especiais, cujas sequências são incomuns em suas características químicas e físicas.Alguns peptídeos são difíceis de sintetizar, enquanto outros são relativamente fáceis de sintetizar, mas difíceis de purificar.O problema prático é que a maioria dos peptídeos são ligeiramente solúveis em soluções aquosas, portanto, em nossa purificação, a parte correspondente do peptídeo hidrofóbico deve ser dissolvida em solventes não aquosos. Portanto, esses solventes ou tampões provavelmente serão gravemente inconsistentes com o uso. de procedimentos experimentais biológicos, de modo que os técnicos são estritamente proibidos de usar o peptídeo para seus próprios fins, de modo que a seguir estão vários aspectos do desenho de peptídeos para pesquisadores.

Esquema de projeto e solução da cadeia peptídica polipeptídica
Em segundo lugar, a escolha correta de peptídeos sintéticos difíceis
1. Comprimento total de sequências reguladas negativamente
Peptídeos com menos de 15 resíduos são mais fáceis de obter porque o tamanho do peptídeo aumenta e a pureza do produto bruto diminui.À medida que o comprimento total da cadeia peptídica aumenta para além de 20 resíduos, a quantidade precisa do produto é uma preocupação fundamental.Em muitos experimentos, é fácil obter efeitos inesperados diminuindo o número de resíduos para menos de 20.
2. Diminuir o número de resíduos hidrofóbicos
Peptídeos com grande predominância de resíduos hidrofóbicos, especialmente na região de 7 a 12 resíduos do terminal C, geralmente causam dificuldades sintéticas.Isto é visto como uma combinação inadequada precisamente porque uma folha dobrada em B é obtida na síntese.“Nesses casos, pode ser útil converter mais de dois resíduos positivos e negativos, ou colocar Gly ou Pro no peptídeo para desbloquear a composição peptídica.”
3. Regulamentação negativa de resíduos “difíceis”
“Existem vários resíduos Cys, Met, Arg e Try que geralmente não são facilmente sintetizados.”Ser normalmente será usado como uma alternativa não oxidativa ao Cys.
Esquema de projeto e solução da cadeia peptídica polipeptídica

Terceiro, melhore a escolha correta de solúvel em água
1. Ajuste o terminal N ou C
Em relação aos peptídeos ácidos (isto é, carregados negativamente em pH 7), a acetilação (acetilação do terminal N, terminal C sempre mantendo um grupo carboxila livre) é particularmente recomendada para aumentar a carga negativa.No entanto, para peptídeos básicos (isto é, carregados positivamente em pH 7), a aminação (grupo amino livre no terminal N e aminação no terminal C) é particularmente recomendada para aumentar a carga positiva.

2. Encurte ou aumente bastante a sequência

Algumas das sequências contêm um grande número de aminoácidos hidrofóbicos, tais como Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr e Ala, etc. Quando estes resíduos hidrofóbicos excedem 50%, geralmente não são fáceis de dissolver.Pode ser útil prolongar a sequência para aumentar ainda mais os pólos positivos e negativos do péptido.A segunda opção é regular negativamente o tamanho da cadeia peptídica para aumentar os pólos positivos e negativos, regulando negativamente os resíduos hidrofóbicos.Quanto mais fortes forem os lados positivos e negativos da cadeia peptídica, maior será a probabilidade de ela reagir com a água.
3. Coloque um resíduo solúvel em água
Para algumas cadeias peptídicas, a combinação de alguns aminoácidos positivos e negativos pode melhorar a solubilidade em água.Nossa empresa recomenda que o terminal N ou o terminal C dos peptídeos ácidos sejam combinados com Glu-Glu.O terminal N ou C do peptídeo básico foi fornecido e depois Lys-Lys.Se o grupo carregado não puder ser colocado, Ser-Gly-Ser também poderá ser colocado no terminal N ou C.No entanto, esta abordagem não funciona quando os lados da cadeia peptídica não podem ser alterados.